故事的起点是传说中的夸克族与暗黑族的对抗，形成了善良与邪恶的两股势力。为了保护结界，一支名为「萌骑士团」的团队组成，他们在「萌学园」中团结一致，共同对抗邪恶势力。整个故事充满奇幻元素，其中「萌学园」里的魔法预言书隐藏着巨大的秘密。在这个奇幻的世界里，奈亚公主和忧伤的艾瑞克之间的纯纯情感逐渐发酵。与此同时，误闯入「萌学园」的坚尼带来了一些未知的冲击，让「萌骑士团」陷入更加紧张的局势。整个故事颠覆了观众对魔幻世界的传统想象，呈现出一个充满幻想和冒险的奇妙旅程。第一季结束后，第二季将迎来更为强大的卡司。第一季的萌骑士团五熊、寒、曾子余、博焱、利昂霖将继续出演，并加入了更加坚强的阵容，包括张善为、草莓姊姊以及人气偶像阿本。寒再次扮演乌克娜娜的角色，表示这次更得心应手，而林奕勋则调侃说寒甚至都不用练习就能上镜演出，实在是令人猴塞雷。随着「萌学园2」的开拍，演员之间的感情更为深厚，为第二季的演出培养了更加默契的团队协作。整个故事在第二季中将继续发展，更多的精彩情节和奇幻元素等待观众一同探索，共同经历这个充满冒险和惊喜的奇幻旅程。